Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AKIP1Q9NQ31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AKIP1Q9NQ31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms