Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOBEC3GQ9HC16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3GQ9HC16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms