Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM45Q9H8W5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM45Q9H8W5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM45Q9H8W5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 497.1 ms