Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL25A1Q9BXS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL25A1Q9BXS0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL25A1Q9BXS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms