Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CITED2Q99967 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CITED2Q99967 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms