Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAD5Q99717 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD5Q99717 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD5Q99717 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms