Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCNAQ96QF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCNAQ96QF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCNAQ96QF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms