Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC7Q96QD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEPDC7Q96QD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEPDC7Q96QD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms