Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf48Q96LS8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf48Q96LS8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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