Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALML4Q96GE6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALML4Q96GE6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALML4Q96GE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALML4Q96GE6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms