Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SIRT1Q96EB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SIRT1Q96EB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SIRT1Q96EB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms