Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN3AQ8TCU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3AQ8TCU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN3AQ8TCU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms