Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms