Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FNDC9Q8TBE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FNDC9Q8TBE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms