Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPD5Q8NDF8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAPD5Q8NDF8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPD5Q8NDF8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms