Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD53Q8N9V6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD53Q8N9V6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD53Q8N9V6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD53Q8N9V6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms