Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC43Q8N309 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC43Q8N309 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC43Q8N309 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms