Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB11FIP4Q86YS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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