Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HS2ST1Q7LGA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms