Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP30Q70CQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP30Q70CQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms