Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CSAG1Q6PB30 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms