Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E4F1Q66K89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E4F1Q66K89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms