Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX30Q5VWJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX30Q5VWJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX30Q5VWJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms