Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP8L3Q5GJ75 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms