Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM16Q2WEN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM16Q2WEN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM16Q2WEN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms