Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDO1Q16878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDO1Q16878 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDO1Q16878 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDO1Q16878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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