Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRY1Q16526 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRY1Q16526 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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