Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 417.55■□□□□ 0.48e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-212ENST00000505087 592 ntTSL 316.31■□□□□ 0.28e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 415.8■□□□□ 0.128e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 414.4□□□□□ -0.18e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 514.39□□□□□ -0.118e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 413.87□□□□□ -0.198e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-215ENST00000508103 610 ntTSL 212.79□□□□□ -0.368e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 412.67□□□□□ -0.388e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-214ENST00000506721 602 ntTSL 512.39□□□□□ -0.438e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 412.38□□□□□ -0.438e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-222ENST00000513972 761 ntTSL 212.28□□□□□ -0.448e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 411.07□□□□□ -0.648e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 48.09□□□□□ -1.118e-38■■■■■ 56.6
EFTUD2Q15029 ABCC10-203ENST00000372515 933 ntTSL 516.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 LZTR1-202ENST00000414985 872 ntTSL 520.69■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 LZTR1-212ENST00000480895 539 ntTSL 413.34□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 LZTR1-217ENST00000497716 1031 ntTSL 513.34□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-205ENST00000505125 3180 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-212ENST00000513975 1464 ntTSL 213.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-210ENST00000511376 582 ntTSL 512□□□□□ -0.491e-19■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 FIP1L1-208ENST00000510668 599 ntTSL 58.54□□□□□ -1.041e-19■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 526.28■■□□□ 1.87e-13■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.547e-13■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RPS2-215ENST00000533872 1114 ntTSL 523.91■■□□□ 1.427e-13■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.387e-13■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.217e-13■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.565e-8■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 515.32■□□□□ 0.043e-44■■■■■ 56.5
EFTUD2Q15029 PLEKHH3-209ENST00000592974 628 ntTSL 316.4■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 PLEKHH3-208ENST00000591544 617 ntTSL 314.91□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 313.87□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 MSH5-216ENST00000484309 857 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 216■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.299e-10■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.119e-10■■■■■ 56.3
EFTUD2Q15029 P3H3-209ENST00000544949 778 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 P3H3-206ENST00000542976 489 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 P3H3-207ENST00000544200 957 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 P3H3-204ENST00000540406 598 ntTSL 415.72■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 P3H3-205ENST00000541956 1102 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-204ENST00000586361 1399 ntTSL 520.9■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-206ENST00000588497 829 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 56.2
EFTUD2Q15029 NFKBID-207ENST00000590094 751 ntTSL 317.31■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 56.2
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EFTUD2Q15029 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 518.56■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 56.1
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 56.1
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EFTUD2Q15029 RPS6KA1-208ENST00000488985 304 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 55.9
EFTUD2Q15029 C11orf95-203ENST00000445014 827 ntTSL 525.89■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 55.8
EFTUD2Q15029 C11orf95-201ENST00000338498 723 ntTSL 1 (best)20.59■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 55.8
EFTUD2Q15029 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 55.7
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EFTUD2Q15029 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.296e-9■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-9■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.436e-9■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 FASTK-203ENST00000459800 449 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-15■■■■■ 55.7
EFTUD2Q15029 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.025e-11■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 WDR6-218ENST00000492780 537 ntTSL 213.56□□□□□ -0.246e-62■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 WDR6-219ENST00000498023 626 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-50■■■■■ 55.6
EFTUD2Q15029 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-13■■■■■ 55.5
EFTUD2Q15029 ZC3H14-224ENST00000557693 593 ntTSL 311.63□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 55.5
EFTUD2Q15029 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.285e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.085e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15□□□□□ -0.015e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.615e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 PDHX-205ENST00000526309 574 ntTSL 38.99□□□□□ -0.975e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 PDHX-206ENST00000532159 560 ntTSL 34.39□□□□□ -1.715e-10■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-202ENST00000466409 2291 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.365e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.015e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-204ENST00000468781 660 ntTSL 221.32■■□□□ 15e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-208ENST00000495641 926 ntTSL 220.91■□□□□ 0.945e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.325e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-206ENST00000488630 2690 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-207ENST00000490488 759 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.355e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-209ENST00000498243 793 ntTSL 212.02□□□□□ -0.495e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.595e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 CARD19-205ENST00000475574 306 ntTSL 510.34□□□□□ -0.755e-13■■■■■ 55.4
EFTUD2Q15029 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 221.98■■□□□ 1.112e-14■■■■■ 55.2
EFTUD2Q15029 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-14■■■■■ 55.2
EFTUD2Q15029 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-14■■■■■ 55.2
EFTUD2Q15029 ZNF639-204ENST00000481587 584 ntTSL 315.27■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 55.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP27-216ENST00000581638 537 ntTSL 419.68■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 55.2
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