RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540406.5

P3H3-204, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

TSL 4

Gene P3H3, Length 598 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3-204ENST00000540406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.98■■■■□ 3.99
P3H3-204ENST00000540406 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.6■■■■□ 3.29
P3H3-204ENST00000540406 ABCC9O60706 1549 aa34.91■■■■□ 3.18
P3H3-204ENST00000540406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.55■■■□□ 2.96
P3H3-204ENST00000540406 NACADO15069 1562 aa33.47■■■□□ 2.95
P3H3-204ENST00000540406 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.47■■■□□ 2.95
P3H3-204ENST00000540406 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
P3H3-204ENST00000540406 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.23■■■□□ 2.91
P3H3-204ENST00000540406 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.07■■■□□ 2.88
P3H3-204ENST00000540406 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.77■■■□□ 2.84
P3H3-204ENST00000540406 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.81
P3H3-204ENST00000540406 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.5■■■□□ 2.79
P3H3-204ENST00000540406 SCRIBQ14160 1630 aa32.5■■■□□ 2.79
P3H3-204ENST00000540406 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.17■■■□□ 2.74
P3H3-204ENST00000540406 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.05■■■□□ 2.72
P3H3-204ENST00000540406 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
P3H3-204ENST00000540406 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.57■■■□□ 2.64
P3H3-204ENST00000540406 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.37■■■□□ 2.61
P3H3-204ENST00000540406 SMARCA4P51532 1647 aa31.06■■■□□ 2.56
P3H3-204ENST00000540406 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
P3H3-204ENST00000540406 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.89■■■□□ 2.53
P3H3-204ENST00000540406 NCAPD3P42695 1498 aa30.88■■■□□ 2.53
P3H3-204ENST00000540406 SMARCA2P51531 1590 aa30.87■■■□□ 2.53
P3H3-204ENST00000540406 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.81■■■□□ 2.52
P3H3-204ENST00000540406 HMGXB3Q12766 1538 aa30.73■■■□□ 2.51
P3H3-204ENST00000540406 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.73■■■□□ 2.51
P3H3-204ENST00000540406 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
P3H3-204ENST00000540406 WIZO95785 1651 aa30.49■■■□□ 2.47
P3H3-204ENST00000540406 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
P3H3-204ENST00000540406 NESP48681 1621 aa30.18■■■□□ 2.42
P3H3-204ENST00000540406 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
P3H3-204ENST00000540406 ERCC6Q03468 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
P3H3-204ENST00000540406 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.1■■■□□ 2.41
P3H3-204ENST00000540406 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.98■■■□□ 2.39
P3H3-204ENST00000540406 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.9■■■□□ 2.38
P3H3-204ENST00000540406 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.83■■■□□ 2.37
P3H3-204ENST00000540406 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.8■■■□□ 2.36
P3H3-204ENST00000540406 CUX2O14529 1486 aa29.8■■■□□ 2.36
P3H3-204ENST00000540406 CFTRP13569 1480 aa29.78■■■□□ 2.36
P3H3-204ENST00000540406 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
P3H3-204ENST00000540406 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.65■■■□□ 2.34
P3H3-204ENST00000540406 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.64■■■□□ 2.34
P3H3-204ENST00000540406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
P3H3-204ENST00000540406 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.61■■■□□ 2.33
P3H3-204ENST00000540406 PRDM2Q13029 1718 aa29.58■■■□□ 2.33
P3H3-204ENST00000540406 WDR62O43379 1518 aa29.5■■■□□ 2.31
P3H3-204ENST00000540406 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
P3H3-204ENST00000540406 TOPBP1Q92547 1522 aa29.16■■■□□ 2.26
P3H3-204ENST00000540406 ABCC8Q09428 1581 aa29.16■■■□□ 2.26
P3H3-204ENST00000540406 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.13■■■□□ 2.25
P3H3-204ENST00000540406 IFT140Q96RY7 1462 aa29.01■■■□□ 2.23
P3H3-204ENST00000540406 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.94■■■□□ 2.22
P3H3-204ENST00000540406 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
P3H3-204ENST00000540406 CUX1P39880 1505 aa28.91■■■□□ 2.22
P3H3-204ENST00000540406 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
P3H3-204ENST00000540406 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
P3H3-204ENST00000540406 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.84■■■□□ 2.21
P3H3-204ENST00000540406 SOGA1O94964 1423 aa28.79■■■□□ 2.2
P3H3-204ENST00000540406 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.78■■■□□ 2.2
P3H3-204ENST00000540406 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
P3H3-204ENST00000540406 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
P3H3-204ENST00000540406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.187e-8■■■■■ 50.1
P3H3-204ENST00000540406 TOP2BQ02880 1626 aa28.65■■■□□ 2.18
P3H3-204ENST00000540406 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.65■■■□□ 2.18
P3H3-204ENST00000540406 SYNJ1O43426 1573 aa28.65■■■□□ 2.18
P3H3-204ENST00000540406 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
P3H3-204ENST00000540406 WDR97A6NE52 1622 aa28.63■■■□□ 2.17
P3H3-204ENST00000540406 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.54■■■□□ 2.16
P3H3-204ENST00000540406 OSCARQ8IYS5 282 aa28.54■■■□□ 2.16
P3H3-204ENST00000540406 GRIN2BQ13224 1484 aa28.47■■■□□ 2.15
P3H3-204ENST00000540406 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.46■■■□□ 2.15
P3H3-204ENST00000540406 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.46■■■□□ 2.15
P3H3-204ENST00000540406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.45■■■□□ 2.14
P3H3-204ENST00000540406 PBRM1Q86U86 1689 aa28.43■■■□□ 2.14
P3H3-204ENST00000540406 CHD1O14646 1710 aa28.43■■■□□ 2.14
P3H3-204ENST00000540406 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
P3H3-204ENST00000540406 FBLN2P98095 1184 aa28.4■■■□□ 2.14
P3H3-204ENST00000540406 SYNJ2O15056 1496 aa28.3■■■□□ 2.12
P3H3-204ENST00000540406 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
P3H3-204ENST00000540406 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.21■■■□□ 2.11
P3H3-204ENST00000540406 ADAMTS12P58397 1594 aa28.2■■■□□ 2.1
P3H3-204ENST00000540406 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.13■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 KIF27Q86VH2 1401 aa28.12■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 GRIN2AQ12879 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.1■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 ARHGEF11O15085 1522 aa28.09■■■□□ 2.09
P3H3-204ENST00000540406 TRIM41Q8WV44 630 aa28.02■■■□□ 2.08
P3H3-204ENST00000540406 CEP170Q5SW79 1584 aa27.98■■■□□ 2.07
P3H3-204ENST00000540406 IGF1RP08069 1367 aa27.98■■■□□ 2.07
P3H3-204ENST00000540406 NUP160Q12769 1436 aa27.97■■■□□ 2.07
P3H3-204ENST00000540406 CUL7Q14999 1698 aa27.96■■■□□ 2.07
P3H3-204ENST00000540406 ARAP1Q96P48 1450 aa27.86■■■□□ 2.05
P3H3-204ENST00000540406 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.84■■■□□ 2.05
P3H3-204ENST00000540406 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.83■■■□□ 2.05
P3H3-204ENST00000540406 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.82■■■□□ 2.04
P3H3-204ENST00000540406 SHROOM2Q13796 1616 aa27.77■■■□□ 2.04
P3H3-204ENST00000540406 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.71■■■□□ 2.03
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