RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544949.5

P3H3-209, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene P3H3, Length 778 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3-209ENST00000544949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.16■■■■■ 4.82
P3H3-209ENST00000544949 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.93■■■■□ 3.98
P3H3-209ENST00000544949 ABCC9O60706 1549 aa38.79■■■■□ 3.8
P3H3-209ENST00000544949 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
P3H3-209ENST00000544949 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.61■■■■□ 3.61
P3H3-209ENST00000544949 NACADO15069 1562 aa37.54■■■■□ 3.6
P3H3-209ENST00000544949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.46■■■■□ 3.59
P3H3-209ENST00000544949 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.46■■■■□ 3.59
P3H3-209ENST00000544949 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.41■■■■□ 3.58
P3H3-209ENST00000544949 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.51■■■■□ 3.43
P3H3-209ENST00000544949 SCRIBQ14160 1630 aa36.44■■■■□ 3.42
P3H3-209ENST00000544949 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
P3H3-209ENST00000544949 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.32■■■■□ 3.41
P3H3-209ENST00000544949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.02■■■■□ 3.36
P3H3-209ENST00000544949 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.42■■■■□ 3.26
P3H3-209ENST00000544949 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
P3H3-209ENST00000544949 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.15■■■■□ 3.22
P3H3-209ENST00000544949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
P3H3-209ENST00000544949 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
P3H3-209ENST00000544949 SMARCA4P51532 1647 aa34.92■■■■□ 3.18
P3H3-209ENST00000544949 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.79■■■■□ 3.16
P3H3-209ENST00000544949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.71■■■■□ 3.15
P3H3-209ENST00000544949 NCAPD3P42695 1498 aa34.68■■■■□ 3.14
P3H3-209ENST00000544949 SMARCA2P51531 1590 aa34.66■■■■□ 3.14
P3H3-209ENST00000544949 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.62■■■■□ 3.13
P3H3-209ENST00000544949 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
P3H3-209ENST00000544949 HMGXB3Q12766 1538 aa34.47■■■■□ 3.11
P3H3-209ENST00000544949 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
P3H3-209ENST00000544949 WIZO95785 1651 aa34.38■■■■□ 3.09
P3H3-209ENST00000544949 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
P3H3-209ENST00000544949 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
P3H3-209ENST00000544949 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.72■■■□□ 2.99
P3H3-209ENST00000544949 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.69■■■□□ 2.98
P3H3-209ENST00000544949 NESP48681 1621 aa33.67■■■□□ 2.98
P3H3-209ENST00000544949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.64■■■□□ 2.98
P3H3-209ENST00000544949 CFTRP13569 1480 aa33.54■■■□□ 2.96
P3H3-209ENST00000544949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.46■■■□□ 2.95
P3H3-209ENST00000544949 ERCC6Q03468 1493 aa33.41■■■□□ 2.94
P3H3-209ENST00000544949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.25■■■□□ 2.91
P3H3-209ENST00000544949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.2■■■□□ 2.9
P3H3-209ENST00000544949 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.16■■■□□ 2.9
P3H3-209ENST00000544949 PRDM2Q13029 1718 aa33.14■■■□□ 2.89
P3H3-209ENST00000544949 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.05■■■□□ 2.88
P3H3-209ENST00000544949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
P3H3-209ENST00000544949 CUX2O14529 1486 aa32.98■■■□□ 2.87
P3H3-209ENST00000544949 WDR62O43379 1518 aa32.92■■■□□ 2.86
P3H3-209ENST00000544949 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
P3H3-209ENST00000544949 ABCC8Q09428 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
P3H3-209ENST00000544949 TOPBP1Q92547 1522 aa32.74■■■□□ 2.83
P3H3-209ENST00000544949 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.71■■■□□ 2.83
P3H3-209ENST00000544949 CUX1P39880 1505 aa32.61■■■□□ 2.81
P3H3-209ENST00000544949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.81
P3H3-209ENST00000544949 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
P3H3-209ENST00000544949 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.49■■■□□ 2.79
P3H3-209ENST00000544949 IFT140Q96RY7 1462 aa32.48■■■□□ 2.79
P3H3-209ENST00000544949 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.44■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 TRIM41Q8WV44 630 aa32.43■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 SYNJ1O43426 1573 aa32.43■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 TOP2BQ02880 1626 aa32.43■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.43■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 SOGA1O94964 1423 aa32.41■■■□□ 2.78
P3H3-209ENST00000544949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.35■■■□□ 2.77
P3H3-209ENST00000544949 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
P3H3-209ENST00000544949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
P3H3-209ENST00000544949 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.19■■■□□ 2.74
P3H3-209ENST00000544949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
P3H3-209ENST00000544949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.749e-8■■■■■ 52.6
P3H3-209ENST00000544949 WDR97A6NE52 1622 aa32.12■■■□□ 2.73
P3H3-209ENST00000544949 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
P3H3-209ENST00000544949 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.01■■■□□ 2.71
P3H3-209ENST00000544949 GRIN2BQ13224 1484 aa31.97■■■□□ 2.71
P3H3-209ENST00000544949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.97■■■□□ 2.71
P3H3-209ENST00000544949 KIF27Q86VH2 1401 aa31.87■■■□□ 2.69
P3H3-209ENST00000544949 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
P3H3-209ENST00000544949 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.84■■■□□ 2.69
P3H3-209ENST00000544949 EEA1Q15075 1411 aa31.82■■■□□ 2.68
P3H3-209ENST00000544949 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
P3H3-209ENST00000544949 PBRM1Q86U86 1689 aa31.8■■■□□ 2.68
P3H3-209ENST00000544949 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.75■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 OSCARQ8IYS5 282 aa31.75■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 IGF1RP08069 1367 aa31.74■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 FBLN2P98095 1184 aa31.72■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 SYNJ2O15056 1496 aa31.72■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
P3H3-209ENST00000544949 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.67■■■□□ 2.66
P3H3-209ENST00000544949 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.67■■■□□ 2.66
P3H3-209ENST00000544949 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.64■■■□□ 2.66
P3H3-209ENST00000544949 ADAMTS12P58397 1594 aa31.62■■■□□ 2.65
P3H3-209ENST00000544949 CHD1O14646 1710 aa31.6■■■□□ 2.65
P3H3-209ENST00000544949 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.54■■■□□ 2.64
P3H3-209ENST00000544949 GRIN2AQ12879 1464 aa31.53■■■□□ 2.64
P3H3-209ENST00000544949 CUL7Q14999 1698 aa31.53■■■□□ 2.64
P3H3-209ENST00000544949 NUP160Q12769 1436 aa31.41■■■□□ 2.62
P3H3-209ENST00000544949 PRXQ9BXM0 1461 aa31.41■■■□□ 2.62
P3H3-209ENST00000544949 KIF21BO75037 1637 aa31.4■■■□□ 2.62
P3H3-209ENST00000544949 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.36■■■□□ 2.61
P3H3-209ENST00000544949 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.35■■■□□ 2.61
P3H3-209ENST00000544949 CEP170Q5SW79 1584 aa31.33■■■□□ 2.61
P3H3-209ENST00000544949 GOLGA3Q08378 1498 aa31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms