Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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