Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
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PLS1Q14651 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLS1Q14651 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PLS1Q14651 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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PLS1Q14651 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLS1Q14651 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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PLS1Q14651 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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PLS1Q14651 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS1Q14651 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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