Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC8Q13216 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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ERCC8Q13216 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ERCC8Q13216 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERCC8Q13216 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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ERCC8Q13216 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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