Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX2Q02962 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX2Q02962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PAX2Q02962 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms