Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG1Q02413 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG1Q02413 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms