Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTF2IP78347 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF2IP78347 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2IP78347 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms