Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P62891 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P62891 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P62891 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P62891 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P62891 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P62891 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P62891 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P62891 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P62891 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P62891 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P62891 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPL39P62891 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P62891 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P62891 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPL39P62891 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPL39P62891 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P62891 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P62891 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P62891 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPL39P62891 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P62891 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P62891 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P62891 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL39P62891 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL39P62891 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL39P62891 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL39P62891 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL39P62891 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL39P62891 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms