Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS25P62851 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS25P62851 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS25P62851 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS25P62851 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS25P62851 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS25P62851 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS25P62851 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS25P62851 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS25P62851 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS25P62851 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS25P62851 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS25P62851 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS25P62851 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS25P62851 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS25P62851 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS25P62851 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS25P62851 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS25P62851 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS25P62851 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS25P62851 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS25P62851 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS25P62851 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS25P62851 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS25P62851 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms