Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2NP61088 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2NP61088 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms