Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC3P51654 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC3P51654 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC3P51654 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC3P51654 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC3P51654 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC3P51654 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC3P51654 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC3P51654 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC3P51654 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC3P51654 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC3P51654 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC3P51654 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC3P51654 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC3P51654 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC3P51654 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC3P51654 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC3P51654 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC3P51654 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC3P51654 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC3P51654 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC3P51654 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC3P51654 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC3P51654 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC3P51654 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC3P51654 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC3P51654 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC3P51654 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC3P51654 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC3P51654 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC3P51654 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC3P51654 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPC3P51654 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPC3P51654 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC3P51654 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms