Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
SMARCA4P51532 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SMARCA4P51532 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC44.32■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SMARCA4P51532 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
SMARCA4P51532 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
SMARCA4P51532 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
SMARCA4P51532 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms