Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL1P40616 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL1P40616 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL1P40616 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL1P40616 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL1P40616 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL1P40616 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL1P40616 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL1P40616 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL1P40616 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL1P40616 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL1P40616 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL1P40616 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL1P40616 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL1P40616 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL1P40616 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL1P40616 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL1P40616 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL1P40616 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL1P40616 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL1P40616 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL1P40616 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL1P40616 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL1P40616 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL1P40616 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARL1P40616 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL1P40616 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL1P40616 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL1P40616 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL1P40616 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARL1P40616 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARL1P40616 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARL1P40616 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL1P40616 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL1P40616 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL1P40616 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL1P40616 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARL1P40616 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARL1P40616 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL1P40616 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL1P40616 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL1P40616 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL1P40616 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms