Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX3P40426 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX3P40426 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX3P40426 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX3P40426 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX3P40426 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX3P40426 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX3P40426 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX3P40426 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX3P40426 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX3P40426 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PBX3P40426 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX3P40426 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PBX3P40426 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PBX3P40426 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PBX3P40426 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PBX3P40426 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PBX3P40426 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX3P40426 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX3P40426 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX3P40426 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX3P40426 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PBX3P40426 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PBX3P40426 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PBX3P40426 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PBX3P40426 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX3P40426 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX3P40426 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX3P40426 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PBX3P40426 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PBX3P40426 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX3P40426 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX3P40426 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX3P40426 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX3P40426 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX3P40426 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX3P40426 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX3P40426 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX3P40426 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX3P40426 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX3P40426 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms