Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR7P32248 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR7P32248 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR7P32248 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR7P32248 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR7P32248 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR7P32248 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR7P32248 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR7P32248 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR7P32248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR7P32248 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR7P32248 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR7P32248 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR7P32248 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR7P32248 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR7P32248 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR7P32248 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR7P32248 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR7P32248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCR7P32248 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR7P32248 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR7P32248 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR7P32248 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR7P32248 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR7P32248 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms