Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P31025 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P31025 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P31025 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P31025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P31025 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P31025 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P31025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P31025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P31025 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P31025 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P31025 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P31025 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P31025 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P31025 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P31025 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P31025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P31025 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P31025 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P31025 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P31025 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P31025 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P31025 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms