Protein–RNA interactions for Protein: P30793

GCH1, GTP cyclohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCH1P30793 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCH1P30793 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCH1P30793 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GCH1P30793 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCH1P30793 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCH1P30793 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCH1P30793 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCH1P30793 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCH1P30793 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCH1P30793 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GCH1P30793 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCH1P30793 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCH1P30793 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCH1P30793 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCH1P30793 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCH1P30793 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCH1P30793 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCH1P30793 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCH1P30793 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCH1P30793 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCH1P30793 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCH1P30793 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms