Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACO1P21399 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACO1P21399 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACO1P21399 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACO1P21399 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACO1P21399 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACO1P21399 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ACO1P21399 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACO1P21399 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACO1P21399 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACO1P21399 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACO1P21399 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACO1P21399 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACO1P21399 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACO1P21399 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACO1P21399 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACO1P21399 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACO1P21399 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACO1P21399 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACO1P21399 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACO1P21399 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACO1P21399 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACO1P21399 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACO1P21399 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACO1P21399 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACO1P21399 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACO1P21399 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACO1P21399 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACO1P21399 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACO1P21399 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACO1P21399 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACO1P21399 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACO1P21399 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACO1P21399 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACO1P21399 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACO1P21399 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ACO1P21399 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACO1P21399 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACO1P21399 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACO1P21399 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACO1P21399 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACO1P21399 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACO1P21399 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACO1P21399 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACO1P21399 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACO1P21399 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACO1P21399 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACO1P21399 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACO1P21399 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACO1P21399 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACO1P21399 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACO1P21399 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACO1P21399 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms