Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNA1P20827 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA1P20827 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.8 ms