Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRHP20396 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRHP20396 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRHP20396 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRHP20396 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRHP20396 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRHP20396 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TRHP20396 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TRHP20396 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TRHP20396 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRHP20396 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRHP20396 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRHP20396 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRHP20396 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRHP20396 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRHP20396 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRHP20396 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRHP20396 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRHP20396 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRHP20396 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRHP20396 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
TRHP20396 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TRHP20396 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRHP20396 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRHP20396 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TRHP20396 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TRHP20396 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRHP20396 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRHP20396 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
TRHP20396 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRHP20396 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRHP20396 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRHP20396 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRHP20396 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRHP20396 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
TRHP20396 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRHP20396 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
TRHP20396 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRHP20396 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRHP20396 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRHP20396 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRHP20396 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRHP20396 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRHP20396 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRHP20396 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
TRHP20396 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRHP20396 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRHP20396 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
TRHP20396 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
TRHP20396 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRHP20396 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
TRHP20396 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRHP20396 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRHP20396 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRHP20396 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRHP20396 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRHP20396 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRHP20396 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRHP20396 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TRHP20396 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRHP20396 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRHP20396 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRHP20396 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRHP20396 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TRHP20396 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRHP20396 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRHP20396 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRHP20396 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRHP20396 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRHP20396 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRHP20396 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRHP20396 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TRHP20396 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRHP20396 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TRHP20396 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRHP20396 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRHP20396 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRHP20396 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRHP20396 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRHP20396 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRHP20396 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRHP20396 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRHP20396 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRHP20396 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRHP20396 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms