Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB6AP20340 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB6AP20340 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6AP20340 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms